肿瘤研究所开展胃癌转移、复发、化疗耐药等机制，胃癌、肠癌的精准治疗，中医药在晚期肿瘤维持治疗的临床和基础，早期肿瘤的筛查及中医药的干预以及肿瘤术后胃肠功能康复等研究。仪器设备总值2000余万元，设有基因工程、流式细胞、高内涵筛选、PCR、细胞培养、成像、质谱、液相色谱等实验平台。与北京大学肿瘤医院、日本国立癌症研究中心、耶鲁大学等十余所著名胃癌诊治机构及科研院所保持较密切的合作关系。

研究所在肿瘤防治研究上取得重要进展，胃癌、胰腺癌根治手术水平位居全国前列；肿瘤微创手术在全省拥有广泛影响力；在全国范围内较早开展晚期胃癌转化治疗，多个临床研究成果在国际会议上展示；开发出多种小动物肿瘤移植模型和术后并发症模型；获各级科技奖励13项，其中省部级奖励3项。近五年，承担国家级科研项目5项，省部级科研项目11项，科研项目经费536万元；在国际知名杂志发表SCI论文22篇（其中1篇获得杂志2015年最高引文奖）；出版著作2部；发明专利授权4项，实用新型专利授权9项。